پیش از به خاکسپاری علی ابن موسی الرضا(ع) به سبب وجود مقبره هارونالرشید، قبهای در این بارگاه وجود داشت. پس از به خاکسپاری امام رضا، این خاک ارج و احترام والایی یافت و از جمله در زمان دیلمیان (حدود 1000 سال پیش) با تزئینات معماری آراسته شد. غزنویان منارههایی به بارگاه افزودند (950 سال پیش) و سلطان سنجر گنبدی بر مزار ساخت و کاشیهای هشت ضلعی سنجری به آن افزود. قرنها بعد سلطان محمد خدابنده از پادشاهان صفوی گنبد فعلی را بر این بارگاه ساخت و آن را طلاکاری کرد و شاه طهماسب صفوی و شاه عباس صفوی آن را تعمیر کرده و یا به آن بخشی را افزودند. طلاکاری ایوانهایی از این بارگاه در دورههای مختلفی از جمله در زمان افشاریان و قاجار به انجام رسید.
وسعت اولیه حرم علی بن موسی الرضا(ع) ۱۲ هزار متر مربع و مساحت فعلی آن یک میلیون متر مربع و دارای ۲۱ رواق، ۴ ایوان، ۴ مدرسه، ۲ سقاخانه، ۹ صحن، ۶ بست و کتابخانه، موزه، مهمانسرا، دارالشفاء، نقارهخانه و مسجد است. مسجد گوهرشاد که نخستین مسجد جامع شهر مشهد محسوب میشود نیز در حرم علی بن موسیالرضا بنا شده است.
اللَّهُمَّ صَلِّ عَلَی عَلِی بْنِ مُوسَی الرِّضَا الْمُرْتَضَی الْإِمَامِ التَّقِی النَّقِی
